• Understanding biological complexity, from genotype to phenotype, with interdisciplinary approaches.

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Bioinformatics and genomics of molecular networks

This research axis aims at deciphering the functional organization of the genome, defining the functional role of non coding transcripts, analyzing the molecular interactions at the DNA, RNA or protein level, developing new strategies to integrate heterogeneous information.

 

Genetics and genomics of multifactorial diseases

This research axis aims at identifying genes and mechanisms underlying the complex phenotypes in multifactorial diseases such as haematological malignancies, sepsis, malaria, and cardiomyopathies.

Education

TAGC Members are actively involved in education and propose various theoretical and practical courses related to molecular biology, genetics, genomics, bioinformatics, statistics and informatics.

Attendees range from BSc, MSc, and PhD students to postdoctoral fellows and researchers.

Next Generation Sequencing Facility - TGML

The Transcriptomic and Genomic Marseille-Luminy (TGML) platform is involved in transcriptomic and genomic data production and analysis since 2001.

TAGC is part of Centuri

The Turing Centre for Living Systems (CENTURI) is an interdisciplinary project located in Marseille (France). CENTURI aims at developing an integrated interdisciplinary community, to decipher the complexity of biological systems through the understanding of how biological function emerges from the organization and dynamics of living systems.

Bioinformatics Resources and Biological Platforms

The TAGC members develop and deploy bioinformatics tools, databases and workflows ranging from next generations sequencing data analysis to network analysis.

The TAGC also own platforms for molecular biology, cell culture imaging and animals breeding.

Our goal

Understanding biological complexity, from genotype to phenotype, with interdisciplinary approaches.

SOUTENANCE DE THÈSE - PHD DEFENSE – Julie BAVAIS

Title: "Computational analysis of Innate Lymphoid Cell ontogeny during embryogenesis"

Friday, November 8, 2024 at 2pm

Auditorium - CIML - 163 Av. de Luminy, 13009 Marseille

 

Composition du jury

- Christine Brun (President)

- Morgane Thomas-Chollier (Reviewer)

- Christelle Harly (Reviewer)

- Rachel Golub (Examiner)

- Stéphane Mancini (Guest)

- Serge van de Pavert (Supervisor)

- Denis Puthier (Co-supervisor)
 

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Events

18 Oct 2024

Internal seminar - Laurent Perrin

News

  1. SOUTENANCE DE THÈSE - PHD DEFENSE – Julie BAVAIS

    Title: "Computational analysis of Innate Lymphoid Cell ontogeny during embryogenesis"

    Friday, November 8, 2024 at 2pm

    Auditorium - CIML - 163 Av. de Luminy, 13009 Marseille

     

    Composition du jury

    - Christine Brun (President)

    - Morgane Thomas-Chollier (Reviewer)

    - Christelle Harly (Reviewer)

    - Rachel Golub (Examiner)

    - Stéphane Mancini (Guest)

    - Serge van de Pavert (Supervisor)

    - Denis Puthier (Co-supervisor)
     

    Abstract

  2. CDD de 18 mois sur la plateforme TGML - IE en expérimentation et instrumentation biologiques
  3. Fête de la Science 2024

    La Fête de la science est une manifestation populaire et gratuite qui célèbre les sciences, les techniques et les innovations sur l’ensemble du territoire. Elle s’adresse à tous les publics et contribue à favoriser le partage des savoirs entre les scientifiques et les citoyens. Cette année elle aura lieu du 4 au 14 octobre.

    Cette année encore, le TAGC participera à la Fête de la Science du 11 au 13 octobre 2024 sur l'Esplanade de la Mairie (Place Villeneuve Bargemon, 13002 Marseille). 

    Merci à Sandrine Marquet et Nathalie Arquier pour leur participation à cet évènement.

  4. SOUTENANCE DE THÈSE - PHD DEFENSE – Juliette MALFAIT

    Title: "The role of Epromoter in the regulation of stress response genes"

    Friday, November 29, 2024 at 2pm

    Auditorium - Hexagone - 169 Av. de Luminy, 13009 Marseille

    Composition du jury: 

    - Guillermo Barreto (President and reviewer)

    - Aleksandra Pękowska (reviewer)

    - Cyril Esnalut (Examiner)

    - Sandrine Marquet (Examiner)

    - Salvatore Spicuglia (Supervisor)
     

    Abstract

  5. " Speed searching " dans le cadre du Festival Explore

    Discussions ludiques et ouvertes à toutes et tous avec des scientifiques toutes les 10 min. Au son du gong, changez de thématique !
    Tous les autres événements sur : explore.univ-amu.fr
    En collaboration avec Aix-Marseille Université et la délégation Provence et Corse du CNRS.

    Bravo à Christophe Chevillard et à Pauline Andrieux pour leur participation à cet évènement.

  6. L'Inserm ouvre un poste d’Ingénieur d'étude à concours au sein du TAGC. 

    Le concours IE n° 15 est destiné à pourvoir un poste d' ingénieur ou d'ingénieure en ingénierie logicielle.

    Affectation

    Théories et approches de la complexité génomique – U1090, Marseille

    Missions

  7. Poste MCF pour Anna Grandchamp

    Un poste de maître de conférences (MCF) en Bioinformatique s'est ouvert cette année au département de Biologie de Aix Marseille Université et avec comme laboratoire d’accueil l'un des laboratoires de recherches suivants: AFMB, IBDM, BIP, LCB, LISM, et TAGC.

    Le résultat est officiel : Anna GRANDCHAMP est l'heureuse élue.

    Bravo Anna!

  8. meeting “CRISPR Screening in Cancer Discovery”

    CRISPR’it Core Facility and CRISPR Screen Action (from PACA region) co-organize the second edition of the meeting “CRISPR Screening in Cancer Discovery”

     

    This event will take place at Institut Curie in Paris on Tuesday 24th of September 2024.

     

    The meeting will bring together international leaders in the field who will present their latest findings on the use of these approaches in the discovery of new therapeutic avenues including immunotherapies, understanding the epigenetic mechanisms underlying tumor growth or the state of art of innovative screening approaches in 3D tumor models (eg organoids, in vivo, etc.).

     

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