Chef de groupe : Génétique et génomique fonctionnelle du paludisme.

Co-responsable communication et culture scientifique.

Membre de l’institut des Maladies Rares de Marseille (MarMaRa) (organisatrice école d’été).
Membre du programme transversal GOLD (Variabilité génomique en matière de santé et de maladies, Inserm).
Membre Action paludisme, I3M (Inserm).

Reviewer pour les journaux:

Journal of Infectious Diseases, Human Immunolgy, Cellular and Molecular Biology letters, Clinical Medicine and Research, Malaria Journal, Journal of Tropical Medicine, Acta Tropica, Case reports in genetics, BioMed Research International, Molecular Genetics and Genomics, eLife, Infection and Immunity, Infection and Drug Resistance, Mediators of Inflammation, International Journal of Molecular Sciences, Nature Communications.

Expert pour les demandes de fianacments des institutions suivantes:

Indo-French Centre for the Promotion of Advanced Research (IFCPAR), Programme d’appui à la recherche en réseau en Afrique (PARRAF),

ANR appel à projets génériques,

Idex Université de Paris

ANR 2025 « Choose France for Science »

Intérêts de recherche

Chef de groupe en génétique et génomique fonctionnelle du paludisme au TAGC depuis 2018. Notre expertise combine la génétique, la biologie moléculaire et cellulaire, la génomique, et la bioinformatique. En s’appuyant sur les données d’études d’association pangénomique ou en réalisant des études du transcriptome sur cellule unique, nous cherchons à caractériser les dysfonctionnements moléculaires et cellulaires responsables du devenir de l’infection par P. falciparum.. Nous avons 1) montré que certains mécanismes sont communs entre le neuropaludisme et les maladies neurodégénératives; 2) identifier des variants génétiques causaux impliqués dans des processus complexes de régulations; 3) identifé un nouveau type d’élément cis-régulateur "ESpromoter". Notre groupe a apporté de nouvelles connaissances dans la compréhension des mécanismes pathogéniques. Notre approche multi-omique actuelle, permettra d’élucid er les interactions hôte-pathogène.
Principaux domaines:
1. Recherche des gènes et variants causaux impliqués dans le développement des formes graves de paludisme.
2. Etude de l’impact des régions cis-régulatrices et des variants génétiques du locus ATP2B4-LAX1 sur les voies TCR/BCR et la susceptibilité au paludisme.
3. Analyse intégrative pour découvrir des biomarqueurs prédictifs du devenir de l’infection palustre.
4. Caractérisation des bases moléculaires de la fonction des éléments cis-régulateurs dans des contextes normaux et pathologiques (Coll. S. Spicuglia).

Enseignement

Master 1 Biologie-Santé International, module « Physiopathologies des maladies infectieuses », Aix-Marseille université.

Master 1 Immunologie, module « Génétique moléculaire et biologie cellulaire », Ax-Marseille Université.

Master 2 Biochimie structurale, Génomique, module « génomique et biologie des systèmes », Aix-Marseille Université.

Encadrement de personnels et d'étudiants

Encadrement d’étudiants et Ingénieurs :
Actuellement :
Loréna Quatreville (doctorante)
Gaelle Farah (doctorante, co-sup. S.Spicuglia, TAGC)
Amélie Escandell (Ingénieur, co-sup. S. Spicuglia, TAGC)
Magali Torres (Ingénieur, mutualisé)
Bruno Pouvelle (Ingénieur, mutualisé)
Abdel Yaya-Oye Akibou (Ingénieur, CDD MADBIO)

Précédemment :
Doctorants et post-doctorant: A. Mathieu (doctorant, co-sup P. Rihet), S. Nisar (doctorante, co-encad P. Rihet), S. Cabantous, I. Safeukui, M. Niang, R. Feliciano, A. Merghani, A. Barros (Post-doctorante, co-encad avec C. Chevillard).

Masters: S. Passabet-labiste (M2), S. Roetynck (M2) , C. Endjineyao-Wakoutou (M2), B. Poudiougou (M2), E. Chevereau (M2), S. Berbache (M2), U. Ewanda Ndoumbe (M2), M. Ouarhache (M2, co-encad C. Chevillard), T. Tran (M2, co-encad P.Rihet), M. Le Phuong Nguyen (M2), M. Adjemout (M2, co-encad P. Rihet), H. Thu Huu (M2, co-encad P. Rihet), G. Farah (M2, co-encad S. Spicuglia), A. Escandell (M2), S. Fontanille (M1), L. Brosseau (M1), N. Blahic (M1, co-encad P.Rihet), M. Matahri (M1), J. Gendre (M1, co-encadrement P. Rihet), M. Adjemout (M1, co-encad P. Rihet), A. Escandell (M1), A. Sahtel (M1), A. Fernandez 2024 (M1), O. Ott 2024 (M1), C. Deschamp (Licence), L. Faedda (Licence), P. Rocheteau (Licence), E. Cornille (ingénieur), D. Josse (BTS), A. Luthier (BTS), B. Mr oimana (BTS), T. Riziki (BTS), S. M’houdini (BTS), V. Coulet (BTS, co-encad M. Torres).

Collaborations

• Ogobara Doumbo, DEAP, Bamako, Mali (2000-2018)
• Marouf Keita, paediatrics department, Gabriel Touré Hospital, Bamako, Mali
• Delmiro fernandez-Reyes, dept of computer science, London, United Kingdon
• Laurent Abel, Institut Imagine, Inserm U1163, Paris, France
• Antoine Claessens, LPHI, UMR5235, Montpellier, France
• Nicolas Blanchard and Antoine Berry, Infinity, UMR1291, Toulouse, France
• Sandrine Nsango, CPC, Yaoundé, Cameroun
• Lionel Spinelli, CIML, Marseille, France
• Lucas Amenga-Etego, Navrongo Health Research Center, Ghana
• Hugues Aschard, Institut Pasteur, Paris, France
• Véronique Adoue, Infinity, UMR1291, Toulouse, France

Financement

ANR MAD-BIO (2023-2027) Coordinatrice
https://anr.fr/Project-ANR-22-CE15-0025

PRI Inserm MalariaOmics (2023-2027) Coordinatrice
https://pro.inserm.fr/decouvrez-les-24-projets-laureats-des-appels-internationaux-de-linserm-en-2022

ANR ENHPROM (2023-2028; Coor S. Spicuglia, TAGC)
https://anr.fr/Projet-ANR-23-CE12-0008

ANR AAPG2025, PATH-CHAGAS (2026-2030; Coor C. Chevillard, TAGC)

Médiation et vulgarisation scientifique

Co-organisatrice de la Fête de la science 2021-2025; Responsable de l'atelier « Les mystères de l’ADN : l’infiniment petit visible à l’œil nu »

Conférence-débat pour le grand public dans le cadre de la Fête de la science 2023

Ambassadrice Declic

Filles et sciences

Les temps forts du mois de juin 2025 de l’Inserm. Une découverte clé sur les gènes et le paludisme : quand un "double interrupteur" génétique complique le puzzle

Actualités Biologie du CNRS (juillet 2025), Résultats scientifiques Génétique, Génomique. Une régulation génétique inédite révélée au cœur du paludisme grave. https://www.insb.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/une-regulation-genetique-inedite-revelee-au-coeur-du-paludisme-grave