Lydie Pradel est une biologiste moléculaire qui étudie la susceptibilité génétique humaine aux maladies. Ses recherches portent sur les mécanismes de dérégulation de l'expression des gènes. Après un doctorat sur le développement du protiste pathogène Trypanosoma Brucei à l'Université de Bordeaux (2005). Elle a rejoint le CIML (Centre d'Immunologie de Marseille- Luminy) pour commencer l'étude de la relation hôte-pathogène (2006-2008) avec l'analyse de la réponse immunitaire des macrophages après infection par Plasmodium berghei Anka et s'est ensuite concentrée sur le processus de dérégulation des gènes dans le développement de la Leucémie Aiguë Lymphoblastique à cellules T (2008-2012). Elle a obtenu un poste permanent de professeur associé en 2012 à l'Université d'Aix Marseille et a rejoint le TAGC U1090.
Ses principaux thèmes de recherche sont actuellement liés à la compréhension des mécanismes de contrôle transcriptionnel qui induisent la (dé)régulation des gènes dans les maladies multifactorielles (sepsis, paludisme et T-ALL). Elle s'intéresse particulièrement à l'épigénomique et à la validation fonctionnelle.

Mots clés : Immunologie, inflammation, infection, sepsis, paludisme, cancer, Massive Parallel Rapporter Assay, CRISPR/Cas9, génomique, biologie moléculaire et cellulaire, région régulatrice, SNP

Enseignement

Aix Marseille Université campus Luminy, St Charles, WUT AMU Wuhan
Biologie Moléculaire, Génétique Moléculaire Eucaryote et Génomique
L1 Portail Louis Pasteur Luminy; L2 BC, SVT Luminy St Charles Wuhan; L3 BC, Biochimie Luminy; Polytech Ingénieur Génie Biologique (4eme année); M1 Immunologie Luminy; M1 BSG; M2 Bilogie Santé Conseil en Génétique; M2 BSG GAD

Encadrement de personnels et d'étudiants

Lauren AGNELLI (2007-08, M1 Biologie des Eucaryotes), Jean-Mickael MAZZELLA (2008-09, M1 Développement-Immunologie), Sabrina BAAKLINI (2012-13, M1 BSG), Solène MONTREUIL (2014, Ecole Polytechnique Nice, 3eme année), Florian ROSIER (2014-15, M1 BSG, Alexandre ESPANA (2015-16, M1 Biologie-Santé), Marwa MATAHRI (2018-19, M1 BSG), Asma SOUIDI (2021-22, M1 Biologie-Santé), Chau PHAM NGOC (M1 BSG 2022-23), Ambre DODARD (M1 Biologie-Santé, 2023)
L. Costa (2007, M2 Développement et Immunologie), K. Ben Salah (2008, M2 Développement et Immunologie), Sabrina BAAKLINI (2013, M2 BSG), Alexandre ESPANA (2016, M2 Biologie Santé), Florian ROSIER (2015, M2 BSG), Marwa MATAHARI (2020, M2 BSG)

Thèses:
Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de Santé, discipline Génomique et Bio-informatique

Alexandre Espana (2016-2019): “Caractérisation des enhancers dérégulés dans la leucémie aiguë lymphoblastique de type T” – soutenue le 13/12/2019
Florian Rosier (2015-2019): « Au-delà des études d'association à l'échelle du génome : Étude transcriptomique et identification des variants régulateurs impliqués dans le développement du sepsis » - soutenue le 20/12/2019

Collaborations

Nathalie Lalevée (C2VN, Marseille), Marc Léone (C2VN, Marseille)
Vahis Asnafi (Hopital Necker, Paris)

Financement

APHM-AAP starter 2022 (2024-2026) , participant- responsable WP
Programme transversal INSERM variabilité génomique(2019-2023), GenOmics variability in health and Diseases, participant
AMIDEX "Emergence & Innovation" (2018-2021), participant
Team label Ligue Contre le Cancer (2018-2022), participant
ARC (2016-2017), participant
Gefluc (2015), participant

References externes

https://orcid.org/0000-0001-6385-5127

Publications de l'auteur