Bioinformatics and genomics of molecular networks
This research axis aims at deciphering the functional organization of the genome, defining the functional role of non coding transcripts, analyzing the molecular interactions at the DNA, RNA or protein level, developing new strategies to integrate heterogeneous information.
Genetics and genomics of multifactorial diseases
This research axis aims at identifying genes and mechanisms underlying the complex phenotypes in multifactorial diseases such as haematological malignancies, sepsis, malaria, and cardiomyopathies.
Education
TAGC Members are actively involved in education and propose various theoretical and practical courses related to molecular biology, genetics, genomics, bioinformatics, statistics and informatics.
Attendees range from BSc, MSc, and PhD students to postdoctoral fellows and researchers.
Next Generation Sequencing Facility - TGML
The Transcriptomic and Genomic Marseille-Luminy (TGML) platform is involved in transcriptomic and genomic data production and analysis since 2001.
TAGC is part of Centuri
The Turing Centre for Living Systems (CENTURI) is an interdisciplinary project located in Marseille (France). CENTURI aims at developing an integrated interdisciplinary community, to decipher the complexity of biological systems through the understanding of how biological function emerges from the organization and dynamics of living systems.
Bioinformatics Resources and Biological Platforms
The TAGC members develop and deploy bioinformatics tools, databases and workflows ranging from next generations sequencing data analysis to network analysis.
The TAGC also own platforms for molecular biology, cell culture imaging and animals breeding.
Our goal
Understanding biological complexity, from genotype to phenotype, with interdisciplinary approaches.
Events
6 Dec 2024
INTERNAL SEMINAR - Cassandre VEDEL
News
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« Speed-searching » dans le cadre de l’évènement « recherches dans la ville »« Speed-searching » dans le cadre de l’évènement « recherches dans la ville » le 4 décembre au parcLongchamp. Des chercheurs et chercheuses des laboratoires d’Aix-Marseille Université seront présents pour échanger et discuter avec le grand public. Pascal Rihet participera à l’évènement.
Les détails de l’évènement sont disponibles sur le site :
https://www.univ-amu.fr/fr/public/actualites/rdv-recherches-dans-la-vill...
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SOUTENANCE DE THÈSE - PHD DEFENSE – Jeremie PERRINTitle : Un modèle diffusif de la signalisation intracellulaire
La marche aléatoire avec retour à l’origine comme modèle de la signalisation et sa paramétrisation à l’aide de la programmation linéaireTuesday, December 17, 2024 at 9:30am
Auditorium - Hexagone - 163 Av. de Luminy, 13009 Marseille
Composition du jury:
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SOUTENANCE DE THÈSE - PHD DEFENSE – Katell AUDOUINTitle: "Etude de l'architecture génétique des variations naturelles du vieillissement cardiaque chez Drosophila melanogaster"
Wednesday, December 18, 2024 at 2pm
Auditorium - Hexagone - 163 Av. de Luminy, 13009 Marseille
Composition du jury:
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Résumé:
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CDD de 18 mois sur la plateforme TGML - IE en expérimentation et instrumentation biologiquesLa plateforme TGML recrute un IE en expérimentation et instrumentation biologiques pour une durée de 18 mois.
La date de prise de fonction est février 2025.
Les CV sont à envoyer par mail à la responsable de la plateforme Béatrice Loriod (beatrice.loriod@inserm.fr).
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SOUTENANCE DE THÈSE - PHD DEFENSE – Juliette MALFAITTitle: "The role of Epromoter in the regulation of stress response genes"
Friday, November 29, 2024 at 2pm
Auditorium - Hexagone - 169 Av. de Luminy, 13009 Marseille
Composition du jury:
- Guillermo Barreto (reviewer), IMoPA
- Aleksandra Pękowska (reviewer), Nencki Institute
- Cyril Esnalut (Examiner), IGMM
- Sandrine Marquet (Examiner), TAGC
- Christophe Chevillard (President), TAGC
- Salvatore Spicuglia (Supervisor), TAGC
Abstract:
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" Speed searching " dans le cadre du Festival ExploreDiscussions ludiques et ouvertes à toutes et tous avec des scientifiques toutes les 10 min. Au son du gong, changez de thématique !
Tous les autres événements sur : explore.univ-amu.fr
En collaboration avec Aix-Marseille Université et la délégation Provence et Corse du CNRS.Bravo à Christophe Chevillard et à Pauline Andrieux pour leur participation à cet évènement.
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L'Inserm ouvre un poste d’Ingénieur d'étude à concours au sein du TAGC.Le concours IE n° 15 est destiné à pourvoir un poste d' ingénieur ou d'ingénieure en ingénierie logicielle.
Affectation
Théories et approches de la complexité génomique – U1090, Marseille
Missions
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SOUTENANCE DE THÈSE - PHD DEFENSE – Julie BAVAISTitle: "Computational analysis of Innate Lymphoid Cell ontogeny during embryogenesis"
Friday, November 8, 2024 at 2pm
Auditorium - CIML - 163 Av. de Luminy, 13009 Marseille
Composition du jury:
- Christine Brun (President)
- Morgane Thomas-Chollier (Reviewer)
- Christelle Harly (Reviewer)
- Rachel Golub (Examiner)
- Stéphane Mancini (Guest)
- Serge van de Pavert (Supervisor)
- Denis Puthier (Co-supervisor)
Abstract:
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Pleiotropic Expression Quantitative Trait Loci Are Enriched in Enhancers and Transcription Factor Binding Sites and Impact More GenesComputational and Structural Biotechnology Journal2024
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