TAGC, Laboratoire Théories et Approches de la Complexité Génomique, est un laboratoire de recherche Inserm/AMU dédié à l'étude des aspects divers et complexes de la complexité génomique. Nos recherches couvrent un large éventail de sujets génomiques, visant à élucider les principes fondamentaux qui régissent l’organisation et le fonctionnement des systèmes génomiques complexes.

Au TAGC, nous nous engageons à :

• Partager les résultats de nos recherches avec le monde pour promouvoir le progrès scientifique et l’innovation.
• Adopter des pratiques de science ouverte, rendant nos recherches librement accessibles à tous.
• Développer et utiliser des outils de pointe pour faire progresser notre compréhension de la complexité génomique.

Plongez dans nos référentiels pour découvrir des projets de recherche, des outils et des ressources liés à la complexité génomique. Participez à nos recherches et contribuez à l’avancement de notre domaine.

WF/pipelines => github

Tools => webservers

• MUFFIN package https://github.com/pdelangen/Muffin
• ReMap pipeline https://github.com/remap-cisreg/remap-pipeline
• pygtftk toolkit https://github.com/dputhier/pygtftk
• libgtftk https://github.com/dputhier/libgtftk
• SciGeneX repository https://github.com/dputhier/scigenex
• mimicINT https://github.com/TAGC-NetworkBiology/mimicINT
• MetamORF https://github.com/TAGC-NetworkBiology/MetamORF
• epiMEIF https://github.com/TAGC-NetworkBiology/epiMEIF
• LedPred https://github.com/aitgon/LedPred
• VTAM https://github.com/aitgon/vtam
• WopMars workflow https://github.com/aitgon/wopmars
• TAGOOS https://github.com/aitgon/tagoos
• ChagasDB https://github.com/TAGC-ComplexDisease/ChagasDB
• MetaWorkflow TGML https://github.com/TGMLplatform/mw-tgml

ApplicationS

databases

TOOLS

https://archive.softwareheritage.org/browse/directory/33e11fd48c03a23097cad4986019ab5e2fef40ac/?origin_url=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01882844&revision=b1e762cae4768d2b8b3ba3d946048e056ccb5e16&snapshot=98f8a7d5abd36bfc38dc2fb907ba9c3adf0bd861