Notre laboratoire a été reconnu comme unité mixte de recherche de l'INSERM et d'Aix-Marseille Université en 2008, sous la direction de Catherine Nguyen. Il est situé sur le campus de Luminy et n'a cessé de croître, passant de 30 personnes en 2008 à 68 aujourd'hui. En utilisant la génétique, la génomique et la bio-informatique, nous cherchons à décrypter les mécanismes biologiques complexes impliqués dans le fonctionnement physiologique des organismes, ainsi que ceux conduisant à des pathologies chez l'homme telles que les hémopathies malignes, le sepsis, le paludisme ou les maladies cardiaques. Pour développer un tel projet, notre laboratoire rassemble des chercheurs et des ingénieurs aux compétences variées (biologie cellulaire et moléculaire, génétique, génomique, bio-informatique), convaincus que nous sommes que la combinaison des approches expérimentales et bio-informatiques permettra l'émergence de nouvelles connaissances et de nouveaux concepts. L'activité de recherche bénéficie de nos installations de génomique (TGML) et de CRISPR.
Notre projet de recherche s'articule autour de deux axes, l'un intitulé « bioinformatique et génomique des réseaux moléculaires », l'autre « génétique et génomique des maladies multifactorielles ». Le premier axe est consacré au décryptage de l'organisation fonctionnelle du génome, à la caractérisation du rôle fonctionnel des ARN non codants, à l'analyse des réseaux d'interactions moléculaires par la génomique et la bioinformatique, et au développement de nouvelles stratégies pour intégrer des informations biologiques hétérogènes dans des modèles théoriques prédictifs. Le deuxième axe vise à caractériser les profils génétiques, transcriptomiques, épigénomiques ou protéomiques associés aux hémopathies malignes, au sepsis, à la malaria ou aux cardiomyopathies, afin d'identifier les éléments régulateurs et les réseaux perturbés par ces pathologies, ainsi que les biomarqueurs et les cibles thérapeutiques pour ces pathologies.
Notre laboratoire est volontairement tourné vers l'interaction interdisciplinaire et l'éducation. Nous menons non seulement des projets de recherche fondamentale, mais aussi des projets de collaboration avec des hôpitaux et des entreprises de biotechnologie. Cette politique s'inscrit pleinement dans le plan stratégique de l'INSERM. De plus, nous sommes fortement impliqués dans la formation universitaire de la licence au doctorat.
Notre laboratoire développe de nombreuses interactions avec les laboratoires de l'Université d'Aix-Marseille. Nous participons aux recherches dans les disciplines considérées comme prioritaires par le comité scientifique de l'université (génétique, immunologie, cancer) et à celles menées par les services hospitalo-universitaires d'immunologie, de reproduction et de neurosciences. Par ailleurs, notre laboratoire est membre des instituts de génétique Marmara, d'onco-immunologie ICI et de l'institut interdisciplinaire CenTuri(http://centuri-livingsystems.org/) qui vise à décrypter la complexité de la vie par des approches interdisciplinaires.
