Responsabilités scientifique et administrative
Chef d'équipe sur la génomique fonctionnelle et le cancer
Labellisation de l'équipe LIGUE contre le Cancer
- Membre du comité scientifique de la Fondation de France (Panel Cancer)
- Membre du comité scientifique du Canceropôle PACA
- Membre du comité scientifique de LIGUE contre le Cancer (panel Hématologie)
Intérêts de la recherche
Je suis chef de groupe en génomique fonctionnelle au TAGC depuis 2011. Nous réunissons une équipe interdisciplinaire de chercheurs et d'ingénieurs avec un large éventail de compétences (biologie cellulaire et moléculaire, (épi)génomique, bioinformatique). Nous avons une longue expérience dans les approches pangénomiques pour décrypter les mécanismes épigénétiques et de régulation des gènes en jeu dans des contextes normaux et pathologiques. En identifiant une classe d'éléments cis-régulateurs (appelés Epromoters) et les processus à l'origine de la dysrégulation épigénétique dans la leucémie, l'équipe a apporté de nouvelles connaissances dans le domaine de la régulation des gènes.
Principaux domaines de recherche :
1. Dynamique épigénétique impliquée dans les transformations oncogéniques et la résistance aux médicaments.
2. Évaluation à haut débit de l'activité cis-régulatrice à l'aide de rapporteurs épisomaux et d'approches basées sur CRISPR.
3. Disséquer la base moléculaire de la fonction enhancer versus promoter des Epromoters dans des contextes normaux et pathologiques.
Enseignement
Module « Biologie des systèmes », Master 2 Biochimie structurale, Génomique, Aix-Marseille Université.
Module « génomique transversale », Master 2 Biologie et Santé, Aix-Marseille Université.
Module « Epigénétique et régulation des gènes », Master 2 en génomique fonctionnelle et protéomique. Université Saint-Joseph, Beyrouth, Liban.
Module « Atelier Bioinformatique », Master 1 Immunologie, Aix-Marseille Université.
Encadrement du personnel et des étudiants
Actuellement :
Yannan Fan (post-doc)
Nathalie Sakakini (post-doc)
Juliette Malfait (doctorante/post-doc)
Gaelle Farah (doctorante, co-sup. S. Marquet, TAGC)
Junhua Su (doctorant)
Andrada Constantinescu (doctorante, co-sup. M. Perez, ABD)
Thomas Steimlé (doctorant, co-sup. V Asnafi, Necker, Paris)
Amélie Escandell (Ingénieur, co-sup. S. Marquet, TAGC)
Iris Manosalva (Ingénieur de recherche, ABD)
Magali Torres (Ingénieur, partagé)
Passé :
Jing Wan (doctorant) / Francesco Leonetti (doctorant, co-sup. M. Perez - ABD) / José David Abad (doctorant ; ingénieur de recherche) / Yasmina Kermezli (ingénieur de recherche) / Megan Charles Alfred (ingénieur) / Antoinette van Ouwerkerer (post-doc) / Davide Cavalieri (chef de projet) / Saadat Hussain (doctorant ; Ingénieur de recherche) / Nori Sadouni (doctorant) / Charbel Souaid (post-doc) / Himanshu Singh (post-doc) / David de Santiago Algarra (doctorant) / Guillaume Charbonnier (doctorant) / Alexandre España (doctorant) / Wiam Saadi (doctorant) / Yasmina Kermezli (doctorante) / Dao Thi Mai Lan (doctorante) / Evelyne Mathieu (post-doctorante) / Ariel Galindo (post-doctorant) / David Hussain (doctorant ; ingénieur de recherche). doc) / Ariel Galindo (post-doc) / Laurent Vanhille (post-doc) / Aurélien Griffon (doctorant) / Mohamed Belhocine (doctorant) / Jaafar Aliomari (doctorant) / Aleksandra Pekowska (doctorante).
Collaborations
Vahid Asnafi (Onco-hematology lab, Necker Hospital, Paris, France)
Mileidys Perez (AdvancesBiodiesign, Lyon, France)
Charles Lecellier (IGMM/LIRMM/IMAG ; Montpellier, France)
Jean Christophe Andrau (IGMM, Montpellier, France)
Angélica Santana (Morelos University, Cuernavaca, Mexico)
Mohamed Belhocine (Arabian Gulf University, Manama, Bahrain)
Romain Roncagalli (CIML, Marseille, France)
ENHPATHY Network (H2020-MSCA-ITN-2019): https://www.enhpathy.eu
CRISPR screen action: https://canceropole-paca.com/propulser-vos-recherches/crispr-screen-action-une-technologie-revolutionnaire-de-modification-du-genome/
Financement
ANR « Remedy » (2021-2024 ; Coor. P. Defossez, Univ. Paris)
ANR « Hu-Thy-L » (2021-2024 ; Coor. A. Toubert, IRSL, Paris)
ANR « LOWCO » (2023-2025 ; Coor. C. Lecellier, IGMM, Montpellier)
Labellisation de l'équipe Ligue Contre le Cancer (2023-2025)
ANR Single-team EnhProm (2023-2028). Coordinateur
ANR LabCom DECIPHER (2025-2030). Coordinateur
Fondation de France (bourse post-doc)
LIGUE contre le Cancer (bourse de doctorat)
FRM (bourse MD-PhD)
Références externes
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-8101-7108
Liste complète des publications :
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=%28%28%28Spicuglia%2C+Salvatore%5BAuthor%5D%29+OR+%28Salvatore%2C+Spicuglia%5BAuthor%5D%29%29+NOT+%28tropeano%5BAuthor%5D%29%29+NOT+%28bignamini%5BAuthor%5D%29&sort=date
Publication de vulgarisation :
Spicuglia et van Ouwerker (2024) « How the dark genome enlightens the molecular mechanisms of diseases », Open Access Government https://doi.org/10.56367/OAG-043-11421
Blogs scientifiques des étudiants d'Enhpathy :
https://www.enhpathy.eu/communication-and-dissemination/all-eyes-on-enhancers/
https://www.enhpathy.eu/communication-and-dissemination/enhancer-in-art/
Enhancer-in-art Pitchs :
https://www.youtube.com/watch?v=b5tbFmNtCwg&t=6s
Podcast InScience :
Présentation du laboratoire de la Fondation Bettencourt Schueller :