TAGC, Laboratoire Théories et Approches de la Complexité Génomique, est un laboratoire de recherche Inserm/AMU dédié à l'étude des aspects divers et complexes de la complexité génomique. Nos recherches couvrent un large éventail de sujets génomiques, visant à élucider les principes fondamentaux qui régissent l’organisation et le fonctionnement des systèmes génomiques complexes.
Au TAGC, nous nous engageons à :
- Partager les résultats de nos recherches avec le monde pour promouvoir le progrès scientifique et l’innovation.
- Adopter des pratiques de science ouverte, rendant nos recherches librement accessibles à tous.
- Développer et utiliser des outils de pointe pour faire progresser notre compréhension de la complexité génomique.
Plongez dans nos référentiels pour découvrir des projets de recherche, des outils et des ressources liés à la complexité génomique. Participez à nos recherches et contribuez à l’avancement de notre domaine.
| Code | https://github.com/TAGC-Inserm | ||
| Données | https://zenodo.org/communities/tagc | ||
| Outils | BactMentha | andreas.zanzoni@univ-amu.fr | |
| ChagasDB | christophe.chevillard@inserm.fr | Brochet P, Mouren JC, Hannouche L, Lopez F, Ballester B, Cunha-Neto E, Spinelli L, Chevillard C. ChagasDB: 80 years of publicly available data on the molecular host response to Trypanosoma cruzi infection in a single database. Database (Oxford). 2023 May 23;2023:baad037. doi: 10.1093/database/baad037. PMID: 37221041. | |
| epromoter | salvatore.spicuglia@inserm.fr | Malfait et al. bioRxiv 2024.11.26.625372 | |
| mimicINT | andreas.zanzoni@univ-amu.fr | Sébastien A Choteau, Kevin Maldonado, Aurélie Bergon, Marceau Cristianini, Mégane Boujeant, et al.. mimicINT: A workflow for microbe-host protein interaction inference. F1000Research, 2025, 14, pp.128. ⟨10.12688/f1000research.160063.2⟩. ⟨hal-05046983⟩
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| ReMap | benoit.ballester@inserm.fr | ReMap 2022: a database of Human, Mouse, Drosophila and Arabidopsis regulatory regions from an integrative analysis of DNA-binding sequencing experiments Fayrouz Hammal, Pierre De Langen, Aurélie Bergon, Fabrice Lopez, Benoit Ballester. Nucleic Acids Research, Volume 50, Issue D1, 7 January 2022 | |
| MoonDB | christine.brun@inserm.fr | ||
| christine.brun@inserm.fr | |||
| ClustnSee3.0 | |||
| OCG | |||