Responsabilités scientifiques et administratives
Directeur-adjoint du TAGC, UMR_S1090 Inserm-AMU (2012-2017 ; 2024-présent); directeur du TAGC (2018-2023)
Membre des conseils de l'institut Marseille Maladies Rares (MarMaRa) et de l'Institut Cancer Immunologie (ICI) depuis 2019
Membre du programme transversal Inserm GOLD (GenOmic variability in heaLth and Disease) depuis 2019
Intérêts de recherche
Je m'intéresse à la malaria, au sepsis et au cancer. L'objectif est de caractériser des variants génétiques et des variations de l’expression de gènes perturbant des réseaux moléculaires et le fonctionnement de types cellulaires particuliers, conduisant ainsi à la pathologie (paludisme, sepsis) ou à une rechute après traitement (cancer). Le projet combine des approches bioinformatiques avec des approches génétiques et transcriptomiques dans des populations humaines et dans des modèles animaux et cellulaires.
Enseignement
J'enseigne dans le master de bioinformatique et dans le master de biologie structurale et génomique. J’étais responsable de l’équipe pédagogique de bioinformatique et génomique de 2008 à 2022, et responsable du master de bioinformatique, biologie structurale et génomique de 2008 à 2017.
Formation doctorale
Actuellement, co-direction de la thèse de Mathieu Adjemout avec Sandrine Marquet
Dans le passé, co-direction de la thèse de Lamia Madaci avec R Costello, de Samia Nisar avec S Marquet, de Florian Rosier avec L Pradel, d'Alassane Thiam avec A Dieye, de Michel Sanka avec C Nguyen, et de Séverine Garnier avec C Nguyen et
Direction de la thèse de Sabrina Baaklini, de Thy Ngoc Nguyen, d'Audrey Brisebarre, de Sarwat Afridi, d'Alexandre Atkinson, de Mathieu Barbier, de Nicolas Delahaye, de Laurence Flori, et de Christophe Aucan
Participation à 63 jurys de thèse ou d'HDR
Membre du conseil de l'école doctorale des sciences de la vie et de la santé ED62 de 2007 à 2024
Collaborations
Collaborations en Afrique :
F Ntoumi, Université de Brazzaville, Congo
A Dieye, B Mbemgue, R Ndiaye, Université Cheikh Anta Diop, Dakar, Sénégal
A Thiam, Institut Pasteur de Dakar, Sénégal
S Sawadogo, Université de Ouagadougou, Burkina Faso
Collaboration en France :
Olivier Theodoly, Inserm-AMU- CNRS U1067, LAI
Financement
Financement A*MIDEX 4.0, projet AMX-22-RE-AB-115
References externes
https://orcid.org/0000-0002-9459-3905
https://scholar.google.fr/citations?user=QbTDp10AAAAJ&hl=fr
http://publicationslist.org/rihet